PRODUCT CLASSIFICATION
產(chǎn)品分類一直以來,科學家們在研究某個基因的功能時無非就只有兩種方法,要么就是敲除這個基因,或者下調(diào)其表達量,要么就是提高其表達量。在20世紀90年代發(fā)現(xiàn)的RNA干擾技術(shù)又給科學家們提供了一條新的研究基因功能的途徑,RNA干擾技術(shù)可以通過小RNA分子(small RNA molecule)與目標mRNA結(jié)合,并使其降解的方式,特異性地抑制某個基因的表達。可是到目前為止,科學家們也只是利用RNAi技術(shù)對體外培養(yǎng)的細胞進行過全基因組篩查研究,這種細胞層面的研究方法不能涉及生理狀態(tài)下細胞之間復雜的相互作用,可我們都知道,這些相互作用對于正常的組織行為,或者癌變等異常的病理改變才都是zui重要的。在本期《自然》(Nature)雜志的第185頁上,Beronja等人將向我們介紹*用RNAi技術(shù)進行的活體(小鼠胚胎)全基因組篩查研究工作,他們的目標是找出與非黑素瘤皮膚癌(non-melanoma skin cancer)形成有關(guān)的基因。
非黑素瘤皮膚癌是zui常見的腫瘤之一,是由皮膚外層的表皮細胞(epidermal cell)惡變而發(fā)生的一種疾病。在胚胎發(fā)育過程中,當進行到孕中期(mid-gestation)時,外胚層(ectoderm)的表面會逐漸發(fā)育成表皮,并慢慢成熟成為一種不通透的皮膚保護屏障,同時也會發(fā)育出毛囊(hair follicle)等皮膚附屬結(jié)構(gòu)。早期的非黑素瘤皮膚癌研究發(fā)現(xiàn),Ras基因家族(Ras gene family)成員是非黑素瘤皮膚癌致病基因,但是由于技術(shù)的限制,不能在單細胞水平對Ras基因的活性進行研究,所以無法了解其它基因在非黑素瘤皮膚癌,以及其它腫瘤發(fā)病過程中起到的致病作用。
Beronja等人之前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一種可以在發(fā)育表皮中進行RNAi操作的方法。他們的方法就是借助慢病毒載體(lentiviral vector)在小鼠胚胎外胚層表層細胞里表達shRNA(這種RNA在細胞內(nèi)表達之后會進一步被切割成RNAi分子)?,F(xiàn)在他們已經(jīng)將這項技術(shù)發(fā)展到可以對表皮細胞的全基因組(外顯子組)進行篩查,這主要歸功于他們有了一個針對小鼠細胞當中每一mRNA的shRNA文庫。由于發(fā)育中的表皮細胞是以一種非常“保守的(reproducible manner)”方式進行分裂增殖的,所以任何RNAi序列,只要它們能夠改變表皮細胞正常的增殖速度,那么就可以通過確定整個RNAi庫中這種RNAi序列數(shù)量(增加或者減少)的方法發(fā)現(xiàn)它們。所以Beronja等人進行了這種研究,他們對RNAi操作開始時和RNAi干擾9.5天之后的小鼠胚胎進行了比較,主要比較了細胞中shRNA的豐度,結(jié)果就發(fā)現(xiàn)了被抑制之后能夠促進細胞增殖,或者抑制細胞增殖的基因。
Beronja等人進行了兩次篩查,分別尋找了與細胞正常發(fā)育有關(guān),以及與細胞癌變(通過誘導Hras1基因表達的方法促使細胞癌變)有關(guān)的基因。在這兩次篩查當中都發(fā)現(xiàn)了同一種基因,那就是β連環(huán)蛋白(β-catenin)編碼基因,但是該基因?qū)@兩種情況下的細胞增殖卻起到了截然相反的作用。之前的研究也發(fā)現(xiàn),β連環(huán)蛋白與非黑素瘤皮膚癌的發(fā)生有關(guān),也發(fā)現(xiàn)如果表皮細胞不表達這種蛋白,也能夠促使細胞增殖(hyperproliferation),Beronja等人的發(fā)現(xiàn)也符合前人的這些研究成果。
β連環(huán)蛋白是粘著連接(adherens junctions)的重要組成部分,所謂粘著連接是一個蛋白復合體,位于上皮組織細胞和內(nèi)皮組織細胞之間,所以β連環(huán)蛋白在細胞之間的粘附作用當中扮演了非常重要的角色。與此同時,β連環(huán)蛋白還是Lef1/Tcf轉(zhuǎn)錄因子家族成員一個非常重要的輔因子(cofactor),而Lef1/Tcf轉(zhuǎn)錄因子家族成員則正是Wnt信號通路的效應因子。由此可見,β連環(huán)蛋白對于多個非常重要的細胞基礎進程都起到了調(diào)控作用。如圖1所示,Beronja等人在篩查研究工作中發(fā)現(xiàn),β連環(huán)蛋白對正常表皮細胞的生長起到了負向調(diào)控的作用。之后的體外試驗又發(fā)現(xiàn)這個負向調(diào)控作用是不依賴于Wnt信號通路的,而是與細胞之間的接觸抑制作用相關(guān)。可是在對表達了Hras基因的小鼠胚胎表皮細胞的篩查工作中卻發(fā)現(xiàn)β連環(huán)蛋白對這種細胞的生長起到了正向調(diào)控的促進作用,這種作用卻又與Wnt信號通路活性上調(diào)相關(guān)。可之前有一項研究發(fā)現(xiàn),在表皮細胞中表達抑制型的(inhibitory form)Lef1,阻斷Wnt信號通路之后對腫瘤的形成造不成明顯的影響。因此,我們還需要開展更多的研究,深入了解β連環(huán)蛋白以及Wnt信號通路對腫瘤的影響作用和意義。
β連環(huán)蛋白與正常細胞和癌變細胞的關(guān)系。Beronja等人對正常的小鼠胚胎表皮細胞,和表達了Hras基因的小鼠胚胎表皮細胞進行了全基因組RNAi研究,發(fā)現(xiàn)β連環(huán)蛋白對于維持表達了Hras基因的小鼠胚胎表皮細胞異?;钴S的增殖非常重要,但他們同時也發(fā)現(xiàn),抑制β連環(huán)蛋白的表達就能夠抑制細胞增殖。Beronja等人認為,這種作用可能與β連環(huán)蛋白在Wnt信號通路中的作用有關(guān)。可是對正常細胞的篩查卻發(fā)現(xiàn)抑制β連環(huán)蛋白的表達卻能夠促進正常表皮細胞的增殖。之后的試驗發(fā)現(xiàn),這種作用與β連環(huán)蛋白在維持表皮細胞之間的粘著連接復合體(adherens-junction protein complexes)方面的作用有關(guān),如果破壞了這種連接復合體,就會影響控制正常細胞生長的接觸抑制機制(contact-inhibition)
之前已經(jīng)有人發(fā)現(xiàn)β連環(huán)蛋白與多種惡性腫瘤疾病相關(guān),但是Beronja等人這一次在表達了Hras1蛋白的異常增殖細胞當中還篩到了另外一個基因,那就是Mllt6基因。之前有人發(fā)現(xiàn),Mllt6基因的染色體轉(zhuǎn)位(Chromosomal translocation)異常與混合型髓性白血?。╩ixed myeloid leukaemia)的發(fā)生有關(guān)。雖然Mllt6蛋白的確切功能現(xiàn)在還不清楚,但是我們已經(jīng)知道,該蛋白與Dot1a組蛋白甲基轉(zhuǎn)移復合體(Dot1a–histone methyltransferase protein complex)在胞內(nèi)的亞細胞定位有關(guān),也能夠?qū)讉€特定的基因網(wǎng)絡(gene network)起到調(diào)控作用。與β連環(huán)蛋白一樣,Mllt6蛋白也是因為Ras基因突變而惡變的腫瘤細胞增殖所必需的因子之一。在Mllt6基因的啟動子上有多個Lef1/Tcf轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點,這說明β連環(huán)蛋白可以通過Wnt信號通路對Mllt6基因的表達起到調(diào)控作用,即Mllt6基因是β連環(huán)蛋白的下游靶標因子。不過我們還需要進行更進一步的研究,以確定β連環(huán)蛋白是否直接調(diào)控了Mllt6基因?是否這兩個因子就足以促使細胞過度增殖?或者Mllt6蛋白是否通過其它信號途徑發(fā)揮了促癌作用?這些問題都是非常重要的問題,因為這決定了開發(fā)靶向藥物所需要確定的作用靶點問題。
Beronja等人開展的這項嶄新的全面式研究給我們提供了大量的信息。他們研究獲得的大量信息為我們將來開展全面的計算機數(shù)據(jù)分析打下了堅實的物質(zhì)基礎。他們發(fā)現(xiàn)的某些基因可能還與表皮附屬器(epidermal appendage)的形成有關(guān),而不僅僅是與細胞的增殖有關(guān)。以這一段胚胎發(fā)育時期的基因表達譜(gene-expression pattern)數(shù)據(jù)為基礎,對Beronja等人獲得的這些數(shù)據(jù)進行篩選也能夠有重要的發(fā)現(xiàn),有助于建起里一個基因分類框架,看看哪些基因與內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài)(homeostasis)相關(guān),哪些基因與發(fā)育相關(guān),哪些基因又是能夠促進細胞生長的癌基因。除此之外,這些與Ras所誘導的細胞增殖作用相關(guān)的基因是所有細胞異常增殖的作用基礎嗎?不同的組織是否進化出各自不同的內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài)控制機制呢?這些都是非常值得研究的問題。
郵箱:1170233632@qq.com
傳真:021-51870610
地址:上海市顧戴路2988號B幢7樓